Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP13A2Q9NQ11 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A2Q9NQ11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP13A2Q9NQ11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP13A2Q9NQ11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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