Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1RAPQ9NPH3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1RAPQ9NPH3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IL1RAPQ9NPH3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IL1RAPQ9NPH3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IL1RAPQ9NPH3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms