Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NGRNQ9NPE2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NGRNQ9NPE2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NGRNQ9NPE2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NGRNQ9NPE2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NGRNQ9NPE2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms