Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN6

GP6, Platelet glycoprotein VI, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP6Q9HCN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GP6Q9HCN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP6Q9HCN6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GP6Q9HCN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GP6Q9HCN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms