Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXNA4Q9HCM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXNA4Q9HCM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms