Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
CENPJQ9HC77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CENPJQ9HC77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CENPJQ9HC77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CENPJQ9HC77 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CENPJQ9HC77 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms