Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CLSPNQ9HAW4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CLSPNQ9HAW4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLSPNQ9HAW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CLSPNQ9HAW4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CLSPNQ9HAW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLSPNQ9HAW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms