Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF2Q9HAK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EBF2Q9HAK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF2Q9HAK2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF2Q9HAK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms