Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSER2Q9H7U1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSER2Q9H7U1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCSER2Q9H7U1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCSER2Q9H7U1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER2Q9H7U1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER2Q9H7U1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER2Q9H7U1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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