Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPF2Q9H7B2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPF2Q9H7B2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RPF2Q9H7B2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms