Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX17Q9H6I2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX17Q9H6I2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX17Q9H6I2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX17Q9H6I2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms