Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
REEP4Q9H6H4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
REEP4Q9H6H4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
REEP4Q9H6H4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
REEP4Q9H6H4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms