Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP4Q9H3Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP4Q9H3Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC42EP4Q9H3Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP4Q9H3Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP4Q9H3Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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