Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASSF4Q9H2L5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASSF4Q9H2L5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF4Q9H2L5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF4Q9H2L5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF4Q9H2L5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms