Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AMBRA1Q9C0C7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AMBRA1Q9C0C7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AMBRA1Q9C0C7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AMBRA1Q9C0C7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms