Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM6Q9C030 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM6Q9C030 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM6Q9C030 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM6Q9C030 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM6Q9C030 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms