Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXQ1Q9C009 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXQ1Q9C009 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXQ1Q9C009 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms