Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM34Q9BYJ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM34Q9BYJ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM34Q9BYJ4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM34Q9BYJ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM34Q9BYJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM34Q9BYJ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM34Q9BYJ4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms