Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC46A2Q9BY10 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC46A2Q9BY10 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC46A2Q9BY10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC46A2Q9BY10 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms