Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms