Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLVAPQ9BX97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PLVAPQ9BX97 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PLVAPQ9BX97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PLVAPQ9BX97 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms