Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SGPP1Q9BX95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SGPP1Q9BX95 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SGPP1Q9BX95 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SGPP1Q9BX95 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms