Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D1Q9BX74 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TM2D1Q9BX74 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TM2D1Q9BX74 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TM2D1Q9BX74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms