Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REPIN1Q9BWE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REPIN1Q9BWE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
REPIN1Q9BWE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
REPIN1Q9BWE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms