Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
HIRIP3Q9BW71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
HIRIP3Q9BW71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
HIRIP3Q9BW71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
HIRIP3Q9BW71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HIRIP3Q9BW71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HIRIP3Q9BW71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms