Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PAGR1Q9BTK6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PAGR1Q9BTK6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PAGR1Q9BTK6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms