Protein–RNA interactions for Protein: Q99593

TBX5, T-box transcription factor TBX5, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX5Q99593 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBX5Q99593 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TBX5Q99593 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TBX5Q99593 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX5Q99593 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms