Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD180Q99467 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD180Q99467 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD180Q99467 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD180Q99467 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD180Q99467 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD180Q99467 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD180Q99467 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD180Q99467 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CD180Q99467 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD180Q99467 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD180Q99467 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD180Q99467 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD180Q99467 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD180Q99467 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD180Q99467 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD180Q99467 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD180Q99467 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD180Q99467 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD180Q99467 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD180Q99467 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD180Q99467 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD180Q99467 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CD180Q99467 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD180Q99467 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD180Q99467 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD180Q99467 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD180Q99467 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD180Q99467 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD180Q99467 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD180Q99467 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD180Q99467 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD180Q99467 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD180Q99467 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD180Q99467 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD180Q99467 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD180Q99467 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD180Q99467 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD180Q99467 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD180Q99467 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD180Q99467 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD180Q99467 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD180Q99467 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD180Q99467 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD180Q99467 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD180Q99467 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CD180Q99467 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CD180Q99467 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD180Q99467 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD180Q99467 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD180Q99467 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD180Q99467 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD180Q99467 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD180Q99467 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD180Q99467 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD180Q99467 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD180Q99467 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD180Q99467 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD180Q99467 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD180Q99467 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD180Q99467 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD180Q99467 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD180Q99467 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD180Q99467 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD180Q99467 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD180Q99467 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD180Q99467 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD180Q99467 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD180Q99467 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD180Q99467 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD180Q99467 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD180Q99467 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD180Q99467 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD180Q99467 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD180Q99467 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD180Q99467 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD180Q99467 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms