Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NOTCH4Q99466 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NOTCH4Q99466 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOTCH4Q99466 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOTCH4Q99466 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOTCH4Q99466 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms