Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMF1Q96S06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMF1Q96S06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMF1Q96S06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMF1Q96S06 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms