Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTAGE1Q96RT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTAGE1Q96RT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CTAGE1Q96RT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTAGE1Q96RT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms