Protein–RNA interactions for Protein: Q96RD7

PANX1, Pannexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1Q96RD7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PANX1Q96RD7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PANX1Q96RD7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PANX1Q96RD7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PANX1Q96RD7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PANX1Q96RD7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms