Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TEFMQ96QE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TEFMQ96QE5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TEFMQ96QE5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms