Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC9Q96Q05 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC9Q96Q05 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC9Q96Q05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC9Q96Q05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms