Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSNARE1Q96NA8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TSNARE1Q96NA8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TSNARE1Q96NA8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSNARE1Q96NA8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms