Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FGD4Q96M96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FGD4Q96M96 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FGD4Q96M96 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD4Q96M96 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD4Q96M96 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms