Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C9orf72Q96LT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C9orf72Q96LT7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C9orf72Q96LT7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C9orf72Q96LT7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms