Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRIM47Q96LD4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRIM47Q96LD4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM47Q96LD4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRIM47Q96LD4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM47Q96LD4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms