Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPNE2Q96FN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPNE2Q96FN4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPNE2Q96FN4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPNE2Q96FN4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms