Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
L3HYPDHQ96EM0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L3HYPDHQ96EM0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
L3HYPDHQ96EM0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms