Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMIM19Q96E16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM19Q96E16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM19Q96E16 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMIM19Q96E16 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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