Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAF2Q96CS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
FAF2Q96CS3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAF2Q96CS3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FAF2Q96CS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 891.2 ms