Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GCC1Q96CN9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
GCC1Q96CN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GCC1Q96CN9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GCC1Q96CN9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GCC1Q96CN9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GCC1Q96CN9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms