Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FUBP1Q96AE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FUBP1Q96AE4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FUBP1Q96AE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FUBP1Q96AE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FUBP1Q96AE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms