Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
TRIM52Q96A61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRIM52Q96A61 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRIM52Q96A61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TRIM52Q96A61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRIM52Q96A61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TRIM52Q96A61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRIM52Q96A61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms