Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC102AQ96A19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC102AQ96A19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC102AQ96A19 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC102AQ96A19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms