Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPTSSAQ969W0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPTSSAQ969W0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPTSSAQ969W0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTSSAQ969W0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms