Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATP2A3Q93084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATP2A3Q93084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATP2A3Q93084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2A3Q93084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2A3Q93084 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms