Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TNPO1Q92973 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TNPO1Q92973 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TNPO1Q92973 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNPO1Q92973 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNPO1Q92973 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNPO1Q92973 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNPO1Q92973 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms