Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL3LQ92901 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL3LQ92901 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL3LQ92901 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms